广东内伶仃-福田国家级自然保护区建于1984年10月，1988年5月升级为国家级自然保护区，2006年10月被国家林业局列为国家级示范保护区，总面积约921.64公顷。由内伶仃岛和福田红树林两个区域组成，两者为海域分割，是两个相对独立的生态系统。

内伶仃岛位于珠江口内伶仃洋东侧，处在深圳、珠海、香港、澳门之间，面积554公顷，最高峰尖锋山海拔340.9米，主要保护对象为国家II级保护兽类猕猴及生境。岛上保存着较完好的南亚热带常绿阔叶林。植物种类繁多，有维管植物821种，其中金毛狗、桫椤、野生荔枝、野生龙眼等为国家重点保护植物。野生动物资源也十分丰富，猕猴总数达1200多只，此外还有水獭、中华穿山甲、黑耳鸢、蟒蛇等重点保护动物。

福田红树林地处深圳湾东北岸，总面积367.64公顷，毗邻拉姆萨尔国际重要湿地香港米埔保护区，共同组成后海湾红树林湿地，是全国唯一处在城市腹地、面积最小的国家级自然保护区，主要保护对象为红树林及水鸟。保护区内有红树植物9科19种，鸟类约200种。每年有近十万只长途迁徙的候鸟在此停歇、越冬，是东亚—澳大利西亚候鸟迁徙通道上重要的“越冬地”、“中转站”和“加油站”。

红树林的生态特征：胎生、泌盐和特殊的根系。福田红树林保护区内有红树植物9科19种，鸟类约200种，是东亚-澳大利西亚候鸟迁徙通道上重要的“越冬地”、“中转站”和“加油站”。 每年有数万只水鸟在红树林湿地栖息越冬，主要包括鹭类、鸭类、鸻鹬类、鸥类、鸬鹚类，其中全球濒危鸟类黑脸琵鹭在此处的数量，2022年1月全球同步调查数据显示，约占全球6%，是全球第三大黑脸琵鹭栖息地。