广东封开黑石顶自然保护区属于典型的北回归线上森林生态系统类型，主要保护对象是热带、亚热带常绿阔叶林及野生动植物，国家珍稀濒危动植物资源及其生境，并重点保护国家二级珍稀濒危保护植物黑桫椤种群、封开蒲葵等特有种及其生境。有珍稀濒危和列为国家Ⅰ、Ⅱ级重点保护物种多达50多种。

　　黑石顶的植被是中国北回归线上最具代表性的地带性植被之一，保存着多样性山地混合森林植被和珍贵稀有生物物种资源。广东封开黑石顶省级自然保护区也是中山大学、肇庆学院、广东生态工程职业学院等高校的野外教学实习基地和肇庆市科普教育基地，每年有约300人次学生前来进行野外生物学实习。